Shinichi Kudo adalah seorang detektif SMA yang terkadang bekerja dengan polisi untuk memecahkan kasus tertentu. Selama penyelidikan, ia disergap dan dilumpuhkan oleh anggota sindikat kejahatan yang dikenal sebagai Organisasi Hitam. Dalam upaya untuk membunuh detektif muda itu, mereka menelan paksa obat percobaan yang berbahaya. Namun, obat tersebut mengubahnya menjadi anak-anak daripada membunuhnya.